همسانه سازی و بررسی ژن های شبه سایکلوتاید در ذرت

سایکلوتایدها دسته­ای بزرگ از پپتیدهای حلقوی هستند که فعالیت­های زیستی متنوعی دارند. از جمله می­توان به فعالیت ضد میکروبی، ضدتوموری، ضدویروسی، تخریب گلبولهای قرمز، سلول­کشی و حشره­کشی اشاره کرد. شبه­ سایکلوتاید ها در گیاهان به صورت خانواده ژنی بیان شده و دارای نواحی حفاظت شده می­باشند. در این پژوهش بر اساس توالی نواحی حفاظت­شده پروتئین آغازگر طراحی شد و با استفاده از تکنیکrace-pcr '3 ژن های کدکننده پروتئین های شبه سایکلوتاید در ذرت همسانه سازی و تعیین توالی شدند. مقایسه توالی­های به­دست آمده با توالی­های موجود در پایگاه داده­های ژنی  pgi نشان داد که تعداد نه ژن شبه­سایکلوتاید جدید در ذرت به­دست آمده است. مقایسه توالی نوکلئوتیدی و اسیدآمینه­ای این ژن­ها آنها را به دو دسته تقسیم کرد. دسته اول شباهت زیادی با سایر شبه­ سایکلوتاید های موجود در پایگاه داده­های ژنی داشته و‏‏ دارای نواحی حفاظت ­شده سایکلوتایدی بودند. دسته دوم دارای ساختار منظم سایکلوتایدی نبودند و تعداد نوکلئوتید های این دو دسته از 485-413 متغیر بود. این اولــین گزارش در زمینه همسـانه­سازی ژن­های شبه­سایکلوتاید در گرامینه­ها بود و نشان داد که ذرت تنوع بالایی از این ژن­ها دارد.